La chiesa ed il cenacolo furono edificati nel 1325 sulle fondamenta di un precedente convento di monache domenicane. nel 1426 il complesso fu ceduto ai Minori Francescani, che lo ristrutturarono ed ampliarono, dotandolo del chiostro oggi esistente. Notevoli furono gli interventi realizzati tra il XVI ed il XVIII secolo, fino al completamento dell'ala settentrionale del chiostro, avvenuto nel 1724.
   
Soppresso il convento nel 1866, il complesso fu ceduto nel 1876 dal Demanio al Comune di Pisa ed adibito dal 1885 a lazzaretto.

Ubicazione: Piazza Santa Croce in Fossabanda, 5, 56125 Pisa