1542 - 1869

Dalla metà circa del 1500 l'area della Cittadella cessa di essere una fortezza militare. Nel 1542 infatti Cosimo I fa abbattere il tratto di mura tra la Torre di S.Agnese e l'Arno. All'interno viene quindi istituito L'Orto Botanico, poi trasferito nell'area di S.Marta.
Nel 1548 si dà inizio alla costruzione degli Arsenali Medicei che terminerà quaranta anni dopo.
Dove prima sorgevano i capannoni dell'arsenale repubblicano viene costruita nel 1747 una caserma per le truppe di cavalleria.
Il Ponte a Mare crolla nel 1869.